Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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