Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms