Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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UBQLN4Q9NRR5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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