Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A4GALTQ9NPC4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A4GALTQ9NPC4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms