Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms