Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms