Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms