Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms