Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms