Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRACR2AQ9BSW2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRACR2AQ9BSW2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms