Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CDRT15Q96T59 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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