Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALPK3Q96L96 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms