Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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