Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms