Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms