Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZNF549Q6P9A3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZNF549Q6P9A3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF549Q6P9A3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms