Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms