Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms