Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms