Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PXDC1Q5TGL8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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