Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms