Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHYHD1Q5SRE7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms