Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms