Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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