Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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CCDC96Q2M329 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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CCDC96Q2M329 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CCDC96Q2M329 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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