Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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