Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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COL24A1Q17RW2 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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COL24A1Q17RW2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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COL24A1Q17RW2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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COL24A1Q17RW2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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COL24A1Q17RW2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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COL24A1Q17RW2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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