Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms