Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms