Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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