Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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