Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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