Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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ALX1Q15699 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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