Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms