Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SS18Q15532 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms