Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH1Q15438 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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