Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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