Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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