Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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