Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms