Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms