Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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