Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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