Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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