Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms