Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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NCOA4Q13772 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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