Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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