Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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