Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TUBB3Q13509 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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