Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.3 ms